Publikationen

2012

• First crenarchaeal chitinase found in Sulfolobus tokodaii

  Staufenberger, T. ., Imhoff, J. F., & Labes, A. . (2012). First crenarchaeal chitinase found in Sulfolobus tokodaii. Microbiological Research, 167, 262–269. Abgerufen von http://oceanrep.geomar.de/12897/

  Abstract

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  This is the first description of a functional chitinase gene within the crenarchaeotes. Here we report of the heterologues expression of the ORF BAB65950 from Sulfolobus tokodaii in E. coli. The resulting protein degraded chitin and was hence classified as chitinase (EC 3.2.4.14). The protein characterization revealed a specific activity of 75 mU/mg using colloidal chitin as substrate. The optimal activity of the enzyme was measured at pH 2.5 and 70 ?C, respectively. A dimeric enzyme configuration is proposed. According to amino acid sequence similarities chitinases are attributed to the two glycoside hydrolase families 18 and 19. The derived amino acid sequence of the S. tokodaii gene differed from sequences of these two glycoside hydrolase families. However, within a phylogenetic tree of protein sequences, the crenarchaeal sequence of S. tokodaii clustered in close proximity to members of the glycoside hydrolase family 18.

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  • 2012
  • Journal Article
  • • Tim Staufenberger
    • Johannes Imhoff
    • Antje Labes
  • • Microbiology
    • Chitinase
    • Glycoside hydrolase
    • Crenarchaea
    • Protein overexpression

• PatMining-Wege zur Erschließung textueller Patentinformationen für das Technologie-Monitoring

  Gerken, J. M. (2012). PatMining-Wege zur Erschließung textueller Patentinformationen für das Technologie-Monitoring. Universität Bremen, Bremen.

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    • Gerken, Jan

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    • Innovation und Wachstum, Nachhaltigkeit
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  • 2012
  • Thesis
  • • Jan Gerken

• A consolidated process for software process simulation: State of the art and industry experience

  Bin Ali, N. ., & Petersen, K. . (2012). A consolidated process for software process simulation: State of the art and industry experience. In 2012 38th Euromicro Conference on Software Engineering and Advanced Applications (S. 327–336).

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  • 2012
  • Conference Paper
  • • Nauman Bin Ali
    • Kai Petersen

• Secondary metabolites of fungi from the German Wadden Sea

  Silber, J. ., Ohlendorf, B. ., Erhard, A. ., Labes, A. ., Goodfellow, M. ., & Imhoff, J. F. (2012). Secondary metabolites of fungi from the German Wadden Sea. In Jahrestagung der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie. Abgerufen von http://oceanrep.geomar.de/19556/

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  • 2012
  • Conference Paper
  • • Johanna Silber
    • Birgit Ohlendorf
    • Arlette Erhard
    • Antje Labes
    • M. Goodfellow
    • Johannes Imhoff

• Software quality trade-offs: A systematic map

  Barney, S. ., Petersen, K. ., Svahnberg, M. ., Aurum, A. ., & Barney, H. . (2012). Software quality trade-offs: A systematic map. Information and Software Technology, 54, 651–662.

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  • 2012
  • Journal Article
  • • Sebastian Barney
    • Kai Petersen
    • Mikael Svahnberg
    • Aybüke Aurum
    • Hamish Barney

• Guideline for the Certification of Offshore Wind Turbines

  Faber, P. D.-I. T. . (2012). Guideline for the Certification of Offshore Wind Turbines.

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    • Faber, Torsten

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  • 2012
  • Report
  • • Prof. Dr.-Ing. Torsten Faber

• Marine fungi: a rich source for natural products

  Silber, J. ., Ohlendorf, B. ., Erhard, A. ., Labes, A. ., & Imhoff, J. F. (2012). Marine fungi: a rich source for natural products. In SUBMARINER Blue Biotechnology Cooperation Event: New Strategies and Future Perspectives. Abgerufen von http://oceanrep.geomar.de/20272/

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  • 2012
  • Conference Paper
  • • Johanna Silber
    • Birgit Ohlendorf
    • Arlette Erhard
    • Antje Labes
    • Johannes Imhoff

• Patientenversorgung verbessern durch interdisziplinäre Kooperation. Erkenntnisse der Arbeits- und Komplexitätsforschung.

  Podtschaske, B. . (2012). Patientenversorgung verbessern durch interdisziplinäre Kooperation. Erkenntnisse der Arbeits- und Komplexitätsforschung. Europäische Schriften zu Staat und Wirtschaft (1. Aufl., Bd. 35, S. 212). Baden-Baden: Nomos.

  Abstract

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  Die Arbeit untersucht das Phänomen „Komplexität“ im Arbeitskontext der Patientenversorgung. Es wird ein Modell entwickelt, welches einen Ordnungsrahmen für die Gestaltung von komplexen Arbeitssystemen darstellt. Der Stand der Komplexitätsforschung, eine Analyse der Patientenversorgung und arbeitswissenschaftliche Erkenntnisse bilden die Grundlage. Mit der Methodik des „Systems Engineering“ erfolgt die Entwicklung des DESPINA-Modells (DESign Principles for Balancing Complex Work Systems IN PAtient Care). DESPINA beschreibt ein Ausbalancieren von vier Spannungsfeldern (Planung, Durchführung, Kontrolle, Ressourcenbereitstellung), die mit Gestaltungsprinzipien verknüpft sind. Für drei Praxisbeispiele („Gesundheitsdaten-Bank eG“, Workshop-Konzept „Fabrica Medica ®“, „Werkzeugkasten“) erfolgt eine Evaluation. Es zeigt sich, dass der Versuch Komplexität zu reduzieren neue Komplexität verursacht: Gelungene Komplexitätsbewältigung hängt also von der Akzeptanz der Komplexität ab.

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    • Podtschaske, Beatrice

  • Profilbereich

    • Gesundheit und Life Sciences

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  • 2012
  • Book
  • • Beatrice Podtschaske

• Bio-mining the microbial treasures of the ocean. Early drug discovery and models for entering pharmaceutical pipelines

  Labes, A. . (2012). Bio-mining the microbial treasures of the ocean. Early drug discovery and models for entering pharmaceutical pipelines. In Rende-vouz de Concarneau. Abgerufen von http://oceanrep.geomar.de/15366/

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  • 2012
  • Conference Paper
  • • Antje Labes

• The Second Skin: Ecological Role of Epibiotic Biofilms on Marine Organisms

  Wahl, M. ., Goecke, F. R., Labes, A. ., Dobretsov, S. ., & Weinberger, F. . (2012). The Second Skin: Ecological Role of Epibiotic Biofilms on Marine Organisms. Frontiers in Microbiology, 3, 292. Abgerufen von http://oceanrep.geomar.de/15124/

  Abstract

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  In the aquatic environment, biofilms on solid surfaces are omnipresent. The outer body surface of marine organisms often represents a highly active interface between host and biofilm. Since biofilms on living surfaces have the capacity to affect the fluxes of information, energy, and matter across the host?s body surface, they have an important ecological potential to modulate the abiotic and biotic interactions of the host. Here we review existing evidence how marine epibiotic biofilms affect their hosts? ecology by altering the properties of and processes across its outer surfaces. Biofilms have a huge potential to reduce its host?s access to light, gases, and/or nutrients and modulate the host?s interaction with further foulers, consumers, or pathogens. These effects of epibiotic biofilms may intensely interact with environmental conditions. The quality of a biofilm?s impact on the host may vary from detrimental to beneficial according to the identity of the epibiotic partners, the type of interaction considered, and prevailing environmental conditions. The review concludes with some unresolved but important questions and future perspectives.

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  • 2012
  • Journal Article
  • • Martin Wahl
    • Franz Goecke
    • Antje Labes
    • Sergey Dobretsov
    • Florian Weinberger
  • • Stress
    • microbe-macroorganism interaction
    • modulation of interactions
    • epibiosis
    • chemical ecology
    • biofilm